清光绪三十一年（1905），南通建成第一条公路——港闸公路后，仿照上海租界章程，对来往车辆挂号发照，征收路费，并派专人管理。由于港闸路系江苏省第一条公路，因此，南通的公路管理在江苏也是最早的。民国初年，南通路工处制定征收特别捐章程，《章程》共15条，分路捐、交通捐、轿捐、广告捐四大类，每年征收总额逾万元，所征经费主要用于公路修建、养护、交通管理费等。1930年，江苏省建设厅公布《江苏省汽车纳捐暂行章程》，统一征收范围和标准，征收款额和养路经费支出均由省建设厅管理。抗战期间，公路管理机构瘫痪，沿线居民在公路边种庄稼、任意挖路的现象严重。抗战胜利后，公路管理侧重于抢修南通辖区内的公路，恢复交通。1947年4月，南通工务总段成立，并接管了六合至吕四、南通至赣榆、如皋至新生港、南通至启东、启东至吕四等352公里的养护、管理任务。总段下设4个工务段、若干道班。
1949年6月，南通公路管理站成立，隶属苏北公路局，负责公路修建、车辆管理、汽车运输和管理交通秩序。同年9月，苏北公路局颁布第一号公告，要求大雨后两天、小雨后一天、连续阴雨放晴后两天，车辆方准行驶，以保证路面不受损坏，违者处以罚款或给予停驶三天的处罚；严禁无照或冒照汽车行驶，严禁挂帮、攀顶等危险乘车行为，检查营运单位的票价是否有任意增减现象。针对公路沿线群众任意破坏引水、排水以及在路边、桥头搭建房屋、摆摊设点和在路肩上种庄稼、堆草积物妨碍正常交通等现象，南通专员公署向各县人民政府发布政令，要求保护公路的完好，为安全行车提供条件。同时，苏北公路局公布了《征收养路费暂行办法》，客车按检定的载客座位，货车按核定的载重吨位，依照运价的百分之五征收养路费，凡银行、工厂、私人自备车及其他企业单位的公用车辆，必须在出发前一次缴清单程养路费，军用车及政府机关部门的公用车免征。